Lo spazio è dedicato esclusivamente al mondo naturale: geologia, zoologia e botanica sono rappresentate da una selezione delle collezioni storiche ottocentesche e da nuclei più recenti, con un rimando all’assetto ottocentesco originario.
Il percorso espositivo accompagna il visitatore in un viaggio evoluzionistico, dal mondo minerale al mondo animale, con un’impronta prettamente storica, dedicata alla formazione delle singole collezioni.
Per i visitatori più giovani è presente un percorso dedicato, che consente, in compagnia della mascotte del museo (Frolik) di approcciarsi alla comprensione delle scienze e del mondo naturale che ci circonda.